Préparer et publier sur GBIF - ArtInStack Documentation

La publication d'une enquête sur GBIF signifie que votre institution devient l'éditeur attitré d'un ensemble de données Camtrap prêt à être collecté ; GBIF explore ensuite cet ensemble et peut attribuer un DOI à l'ensemble de données. ArtInStack crée et (éventuellement) héberge le paquet ; elle ne devient pas l’éditeur de vos données.

Pourquoi l’aval et « Instant Connect » (par opposition à l’accès délégué) sont importants pour les institutions : Publication sur GBIF : l’aval d’abord. Cette page présente la procédure étape par étape.

Exporter le paquet Camtrap DP (fichier zip partenaire) reste disponible en tant qu’action distincte. Préparer pour le GBIF correspond au parcours de collecte : cette étape valide la licence et les données, recueille les choix explicites (omettre les entrées incomplètes, les données floues ou masquer les coordonnées sensibles) et prépare le paquet pour le téléchargement et/ou la publication.

Deux façons d’accéder au GBIF (après l’étape « Préparer »)

Tout le monde commence de la même manière : Préparer génère un fichier zip de collecte. Choisissez ensuite comment ce fichier zip parvient sur GBIF :

	Publier depuis ArtInStack (habituellement)	Publier sur votre propre IPT (manuellement)
Qui héberge le fichier ZIP	ArtInStack (URL du paquet prêt à l’envoi)	Votre IPT (ou installation équivalente)
Sur quoi cliquer	GBIF → Publier	Téléverser le fichier ZIP dans l’IPT, puis GBIF → Suivre la publication IPT…
Paramètres → Intégrations → GBIF	Obligatoire (Instant Connect ou accès délégué)	Non requis pour le téléchargement ou le suivi
Statut de l’étude	Exploration demandée → Publié sur GBIF	IPT · suivi → Publié sur GBIF
Crédit / DOI	Votre organisme de publication	Votre organisme de publication

Utilisez Publier depuis ArtInStack lorsque vous souhaitez que l’enregistrement et l’indexation s’effectuent sans quitter le tableau de bord. Utilisez votre propre IPT lorsque votre institution utilise déjà IPT et souhaite que toutes les étapes techniques se déroulent en interne.

Conditions préalables

Des relevés de terrain prévus dans votre programme (rubrique Projets → Relevés visible)
Une institution pouvant devenir (ou étant déjà) une organisation éditrice du GBIF ; il ne s’agit pas d’un photographe indépendant sans affiliation
Un relevé comportant des observations d’animaux accompagnées de noms scientifiques (recommandé par le GBIF)
Licence de l’étude définie sur CC0 1.0, CC BY 4.0 ou CC BY-NC 4.0 dans les détails de l’étude (obligatoire avant l’étape « Préparer »)
Pour Publier depuis ArtInStack : Paramètres → Intégrations → GBIF configurés (voir ci-dessous)
Pour votre propre IPT : un IPT déjà géré par votre organisation. Aucune configuration d'intégration n'est requise pour télécharger un fichier zip préparé ou pour suivre la publication de l'IPT

Avant de commencer la préparation : validation et mention des crédits

Enregistrez / faites valider votre organisation auprès de votre nœud national (ou via la procédure de participation) afin de pouvoir publier en ligne sur gbif.org. La validation s’effectue en dehors de ArtInStack et peut prendre plusieurs jours ; préparez donc vos données en parallèle.
Veillez à ce que les mentions de crédit soient claires : l’organisation éditrice est toujours votre ONG ou votre laboratoire. ArtInStack peut techniquement héberger le fichier ZIP ; il ne remplace en aucun cas votre organisation en tant qu’éditeur.
Utilisez l’environnement de test/sandbox du GBIF uniquement pour vous entraîner au conditionnement et aux mécanismes d’exploration. Il ne remplace pas l’agrément en production par le nœud.

Définir la licence de l’enquête

Le GBIF exige que la licence du jeu de données soit l’une des trois licences ouvertes suivantes. Configurez ce paramètre dans les Détails de l’enquête (et non dans la fenêtre modale « Préparer ») :

Autorisé pour l’enquête	Remarques
CC0 1.0	Mise dans le domaine public
CC BY 4.0	Attribution
CC BY-NC 4.0	Attribution-Non commercial

La preuve d’impact sur votre site web constitue un article public distinct. Un paquet de collecte est un ensemble de données d’occurrences ouvert ; veillez donc à définir la licence de manière réfléchie avant de lancer la « Préparation ».

Connexion instantanée ou accès délégué

Ouvrez Paramètres → Intégrations → GBIF avant de publier depuis ArtInStack (les relevés de terrain doivent être inclus dans votre forfait). Ignorez cette section si vous publiez uniquement sur votre propre IPT. Ces deux modes conservent votre organisation comme éditeur GBIF ; ils modifient uniquement la manière dont ArtInStack s’authentifie lors de l’enregistrement du jeu de données.

Mode de connexion	Ce que vous saisissez	Quand l’utiliser
Connexion instantanée (BYO, recommandé)	Clé de l’organisation éditrice (UUID) + nom d’utilisateur et mot de passe (ou jeton) du compte de service GBIF	En libre-service ; les identifiants restent stockés dans un coffre-fort pour la publication ; pas d’attente auprès du service d’assistance
Accès délégué	Clé de l’organisation uniquement	Votre nœud accorde des droits d’éditeur au sein de votre organisation au nom d’utilisateur de la plateforme ArtInStack (affiché sur la fiche « Intégrations » ; copiez-le pour le service d’assistance). À n’utiliser qu’une fois cette autorisation confirmée

Enregistrez les paramètres avant de publier. Instant Connect n’attend pas l’autorisation du service d’assistance ; l’accès délégué, oui.

Préparation pour le GBIF (pour chaque relevé)

Sur la page de détails du relevé :

Ouvrez le menu GBIF → Préparer.
Vérifiez la liste de contrôle : badge de licence, lignes d’animaux incluses, ébauches/non classées (omises par défaut des occurrences), dates manquantes et occurrences sensibles selon l’UICN.
Si des taxons sensibles sont signalés, choisissez Coordonnées approximatives (rayon par défaut de l’étude) ou Ne pas divulguer lat/lng. La rédaction des données publiques ne suffit pas pour la collecte ; GBIF a besoin de coordonnées exploitables ou d’une incertitude déclarée.
Choisissez si vous souhaitez inclure les liens vers les images dans l’exportation (désactivé par défaut) :
- Désactivé (par défaut) : le pack ne contient que les métadonnées pour les médias. Les lignes d’occurrence sont toujours publiées ; les photos n’apparaissent pas sur les pages d’occurrence du GBIF via les liens de votre ensemble de données.
- Activé : les médias publics peuvent recevoir des URL d’images publiques afin que les photos puissent s’afficher sur le GBIF. Les choix relatifs aux emplacements sensibles (approximation / non divulgation) s’appliquent toujours aux coordonnées dans les tableaux.
Si la liste de contrôle indique que les médias privés ne seront pas liés, consultez la liste d’exemple. Les fichiers stockés dans un espace de stockage privé (icône de cadenas dans la section Médias, y compris les fichiers téléchargés dans des portfolios privés) ne reçoivent jamais de liens d’image publics, même lorsque l’option Inclure les liens vers les images est activée. Téléchargez à nouveau ces ressources en tant que médias publics si vous souhaitez qu’elles soient liées aux pages d’occurrence du GBIF. La ligne apparaît comme Avis lorsque les liens sont désactivés, et Ignoré lorsqu’ils sont activés.
Corrigez les obstacles (licence, ensemble d’inclusion vide, choix spatial manquant) dans les détails de l’enquête ou dans la section « Médias », puis rouvrez la fenêtre « Préparer ».
Cliquez sur Préparer. ArtInStack génère le fichier ZIP de collecte et le place en attente (l’enquête affiche En attente).
Facultatif : GBIF → Télécharger pour obtenir une copie locale du même paquet mis en attente (nécessaire si vous publiez sur votre propre IPT).

Les ébauches et les lignes non classées restent associées à l’espace de travail de l’enquête ; elles sont omises des occurrences de la collecte, sauf si vous terminez l’identification ultérieurement et relancez la préparation.

Les liens vers les images sont facultatifs et indépendants de la confidentialité des coordonnées. L’activation des liens ne contourne pas les règles de fuzz, de non-divulgation ou de stockage privé.

Publier depuis ArtInStack

Utilisez cette option lorsque vous souhaitez que ArtInStack héberge le fichier mis en attente et enregistre le jeu de données pour l’exploration :

Remplissez Paramètres → Intégrations → GBIF avec Instant Connect ou Accès délégué.
Terminez la préparation afin que l’étude soit prête à être publiée.
Ouvrez GBIF → Publier. ArtInStack enregistre ou met à jour le jeu de données sous la clé de votre organisation et demande un balayage de l’URL du paquet en attente de publication. Il ne recrée pas le fichier zip lors de la publication.
Si vous modifiez des observations ou les préférences de Préparation après la mise en attente, relancez Préparation avant de publier afin que le paquet en attente corresponde bien à ce que vous avez vérifié.

Publier sur votre propre IPT

Utilisez cette option lorsque votre institution dispose déjà d’un IPT (ou d’une installation équivalente) et que vous préférez télécharger le paquet vous-même :

Effectuez la Préparation, puis sélectionnez GBIF → Télécharger pour obtenir le fichier zip prêt à être publié.
Dans votre IPT, créez une nouvelle ressource de type « Camera Trap Data Package (Camtrap DP) » en téléversant ce fichier zip en tant qu’archive (et non pas uniquement des métadonnées). L’IPT importe simultanément les métadonnées, les tableaux et les mappages.
Vérifiez que le statut des métadonnées est Valide, puis publiez la ressource sous votre organisation de publication afin que GBIF puisse indexer votre IPT. La mention de la source du jeu de données et le DOI restent attribués à votre organisation.
De retour dans ArtInStack, ouvrez GBIF → Suivre la publication IPT…, collez la clé du jeu de données GBIF (UUID), puis enregistrez. La vue d’ensemble affiche IPT · suivi jusqu’à ce que les occurrences soient indexées (Publié sur GBIF). Cette étape ne réimporte pas le fichier zip ; elle se contente de lier l’enquête au registre afin que le statut (et les données probantes) puissent suivre le même ensemble de données.

À éviter lors du téléchargement de paquets Camtrap vers IPT :

Créer une ressource contenant uniquement des métadonnées, puis ajouter des sources CSV ultérieurement
Remplacer les fichiers source d’une ressource dont les métadonnées sont déjà non valides et s’attendre à ce que les métadonnées s’actualisent — créez plutôt une nouvelle ressource et téléchargez à nouveau l’archive

Vous n’avez pas besoin de « Paramètres → GBIF » pour télécharger un fichier zip en attente ou pour suivre la publication sur IPT. Conservez Exporter Camtrap DP pour le transfert à un partenaire lorsque vous souhaitez un paquet brut sans options de préparation à la collecte.

État de l'enquête GBIF

État	Signification
Préparé	Paquet construit et prêt ; pas encore enregistré auprès de GBIF depuis ArtInStack
Exploration demandée	Vous avez utilisé Publier depuis ArtInStack ; GBIF est en train de récupérer et d’indexer les données
IPT · suivi	Vous avez associé une clé de jeu de données après publication sur votre propre IPT ; en attente d’indexation
Publié sur GBIF	Les occurrences semblent indexées pour cette enquête
Échec	Échec de la synchronisation ou de l’ingestion ultérieure. Lisez le message d’erreur, corrigez les intégrations ou la préparation, puis réessayez

« Préparer » vs « Exporter » le DP Camtrap

Action	Objectif
Exporter le DP Camtrap	Pack partenaire complet issu du relevé (tables Camtrap habituelles) ; pas de fenêtre modale de pré-vérification de la collecte
Préparation pour GBIF	Validation interactive + fichier ZIP prêt à la collecte avec contrôle de licence, omission des entrées incomplètes, options de flou/rétention et liens vers des images facultatifs ; étapes pour le téléchargement / la publication
Téléchargement (menu GBIF)	Copie locale du fichier ZIP de collecte préparé (n'est pas reconstruit)
Publier (menu GBIF)	Enregistrement/exploration depuis ArtInStack (intégrations requises)
Suivre la publication sur IPT…	Coller la clé du jeu de données GBIF après avoir publié le fichier ZIP sur votre propre IPT

Étapes (procédure rapide)

Confirmez l’aval de l’éditeur institutionnel (ou poursuivez dans l’environnement de test à des fins d’entraînement uniquement).
Définissez la licence de l’étude sur CC0, CC BY ou CC BY-NC.
Complétez les noms scientifiques des animaux ; décidez s’il faut flouter ou ne pas publier les taxons sensibles ; déterminez si les liens vers les images doivent figurer dans cette collecte.
GBIF → Préparer (l'étude apparaît comme En attente).
Soit configurez « Intégrations » → « GBIF » puis « Publier », soit « Téléchargez » le fichier ZIP, téléversez-le sur votre IPT en tant qu’« archive » Camtrap DP, puis « Suivre la publication IPT… » à l’aide de la clé du jeu de données.
Attendez l’exploration et l’indexation ; ne réclamez un DOI actif que lorsque le jeu de données figure effectivement sur GBIF sous le nom de votre organisation.

Vérification de votre configuration

La licence de l’enquête indique l’une des trois valeurs acceptées par GBIF dans les détails de l’enquête.
La liste de contrôle « Préparer » atteint le statut Préparer sans obstacle ; l’enquête affiche le statut En attente.
L’option Inclure les liens vers les images correspond à votre intention (désactivée = médias sous forme de métadonnées uniquement ; activée = les médias publics peuvent comporter des liens).
Les fichiers stockés en privé dans la liste de contrôle restent non liés même lorsque les liens vers les images sont activés.
Publier depuis ArtInStack : Instant Connect ou Accès délégué est enregistré ; la publication aboutit ; le statut passe à Exploration demandée, puis à Publié sur GBIF.
Votre propre IPT : les métadonnées IPT sont valides ; la ressource est publiée ; Suivi de la publication IPT… est enregistré avec la clé du jeu de données ; le statut indique IPT · suivi, puis Publié sur GBIF.
Les lignes sensibles respectent votre choix de floutage ou de non-divulgation, et non une réécriture automatique silencieuse.
Le crédit sur GBIF revient à votre organisme éditeur, et non à ArtInStack.

Dépannage et pièges courants

Symptôme	À vérifier
Fonction « Préparer » désactivée	Licence non conforme à CC0 / CC BY / CC BY-NC ; absence de lignes d’animaux nommés ; les taxons sensibles nécessitent un masquage partiel ou une non-divulgation
La liste de contrôle signale que les médias privés ne seront pas liés	Ce comportement est normal pour les fichiers stockés en mode privé. Les liens nécessitent des médias publics ; téléchargez-les à nouveau en mode public si vous souhaitez que GBIF affiche ces photos.
Les liens vers les images sont actifs mais certaines photos manquent toujours sur GBIF	Ces lignes peuvent se trouver dans le stockage privé, ou les liens étaient désactivés lors de votre dernière « Préparation » — relancez la « Préparation » après avoir corrigé le stockage ou activé le bouton.
Téléchargement désactivé	Aucun paquet en attente pour le moment. Lancez d’abord la « Préparation ».
Échec de la publication (authentification / droits)	Identifiants Instant Connect ; ou autorisation déléguée non confirmée pour le nom d’utilisateur de la plateforme
La publication vous demande de relancer la fonction « Préparer »	Les données d’enquête ou les choix de « Préparer » ont été modifiés depuis la dernière exécution de « Préparer ». Lancez « Préparer », puis « Publier ».
Statut bloqué sur « Crawl demandé » ou « IPT · suivi »	L’exploration/l’indexation GBIF est asynchrone. Patientez, puis utilisez « Vérifier à nouveau » (limité) ou confirmez sur la page du registre / de l’ensemble de données.
Photographe indépendant bloqué à l’étape de validation	Ce comportement est normal. Le GBIF publie au nom d’organisations ; consultez le guide de validation.
Les métadonnées IPT restent non valides après le téléchargement	Créez une nouvelle ressource Camtrap DP et téléchargez le fichier zip de préparation en tant qu’archive. N’utilisez pas l’option « métadonnées uniquement » + ajouter des fichiers CSV. Le remplacement de la source sur une ressource invalide n’actualise souvent pas les métadonnées.
Le journal de la source IPT indique « aucune ligne ignorée » mais les métadonnées sont invalides	Ce comportement est normal. Ce journal ne couvre que l’importation des fichiers CSV. Utilisez la création d’archive (ci-dessus) ou ouvrez le rapport de validation IPT / le formulaire de métadonnées.
Vous souhaitez connaître le statut de l’enquête après la publication IPT	GBIF → Suivre la publication IPT… avec la clé du jeu de données GBIF. Le statut indique IPT · suivi jusqu’à l’indexation.

Étape suivante dans ce flux

Présentation de la conservation et du travail de terrain

Documentation associée